การหยุดชะงักของความอดทนของทีเซลล์ต่อการควบคุมโดยตัวรับจุดตรวจสอบภูมิคุ้มกัน
กระบวนการยอมรับจากส่วนกลางและส่วนปลายควบคุมความจำเพาะของทีเซลล์และการเปิดใช้งาน ไธมัสแสดงตัวอย่างที่น่าทึ่งของความทนทานต่อส่วนกลางในช่วงระยะเริ่มต้นของการพัฒนาทีเซลล์ภายในนั้น  สล็อต มันรับประกันการตายของเซลล์ T ซึ่งตัวรับ (TCRs) ผูกมัดคอมเพล็กซ์ความเข้ากันได้ของเนื้อเยื่อที่สำคัญในตัวเอง (MHCs) อย่างเข้มข้น กระบวนการนี้ทำงานที่มีประสิทธิภาพ 60 ถึง 70% กำจัดโคลน T-cell ที่อาจทำปฏิกิริยาอัตโนมัติทั้งหมด

สำหรับทีเซลล์ที่ทำปฏิกิริยาอัตโนมัติที่เหลืออยู่ เช่น คลัสเตอร์ของความแตกต่าง (CD)4+ และ CD8+ ทีเซลล์ที่ต่อต้านเคราติน (แอนติเจน) ได้รับการดูแลโดยกลไกความทนทานต่อส่วนปลาย ได้แก่ การกดทับแบบแอคทีฟ ความโกรธ และความไม่รู้ของโคลน . ตัวอย่างเช่น ความไม่รู้แบบโคลนนิ่งทำให้ทีเซลล์ที่ตอบสนองต่อตัวเองอยู่ในสถานะไร้เดียงสา/ตอบสนองน้อย; อย่างไรก็ตาม นั่นต้องการให้แอนติเจนในตัวเองแสดงเฉพาะในบริเวณทางกายวิภาคที่ระบบภูมิคุ้มกันไม่สามารถเข้าถึงได้เท่านั้น (เช่น อัณฑะ สมอง และดวงตา)

การศึกษาความสัมพันธ์ทั่วทั้งจีโนม (GWASs) ได้แสดงให้เห็นความสัมพันธ์ที่แข็งแกร่งของอัลลีล MHC-II ในการยกระดับความเสี่ยงของโรคภูมิต้านตนเองหลายชนิด เช่น โรคปลอกประสาทเสื่อมแข็ง (MS) เบาหวานชนิดที่ 1 โรคลูปัส erythematosus (SLE) และโรคข้ออักเสบรูมาตอยด์ ( ร.อ.). ที่นี่ เอฟเฟกเตอร์ CD4+ ทีเซลล์ยังช่วยขยายพันธุ์และรักษาภูมิต้านทานตนเอง เช่นเดียวกับมะเร็งที่เกี่ยวข้องกับการติดเชื้อ (เช่น มะเร็งปากมดลูก) ก้อนเนื้องอก และมะเร็งทางโลหิตวิทยา GWAS ได้แสดงความสัมพันธ์ระหว่างยีน MHC/ไม่ใช่ MHC และกระบวนการภูมิคุ้มกัน ข้อมูลนี้เน้นย้ำถึงความจำเป็นในการปรับแต่งภูมิคุ้มกันบำบัดในอนาคตเพื่อปลดปล่อยการตอบสนองของ CD4+ ทีเซลล์ต้านเนื้องอก เพื่อให้ได้ภูมิคุ้มกันต้านเนื้องอกแบบถาวร

ทีเซลล์ธรรมดา เมื่อเปิดใช้งาน แสดง CD152; อย่างไรก็ตาม เซลล์ควบคุม T (Treg) มีระดับสูงสุดของการแสดงออกของ CD152 และการลบแบบมีเงื่อนไขส่งผลให้เกิดการกระตุ้นมากเกินไปซึ่งนำไปสู่ภูมิต้านทานผิดปกติในมนุษย์ ในทำนองเดียวกัน การลบสายพันธุกรรมของโปรตีนการตายของเซลล์ที่ตั้งโปรแกรม 1 (PD-1) อาจนำไปสู่การสร้างภูมิต้านทานผิดปกติในผู้ที่มีองค์ประกอบทางพันธุกรรมที่อ่อนแอ ตัวอย่างเช่น รายงานกรณีศึกษาอธิบายว่าเด็กที่มีภาวะพร่อง PD-1 ที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมมีภูมิคุ้มกันบกพร่องต่อวัณโรคซึ่งส่งผลให้เกิดภูมิคุ้มกันทำลายปอดโดยอัตโนมัติในภายหลังได้อย่างไร

จุดตรวจสอบภูมิคุ้มกันอื่น ๆ ยังอยู่ในระดับแนวหน้าเมื่อมีการกระตุ้น T-cell ซ้ำ ๆ ในระบบภูมิต้านทานผิดปกติและมะเร็ง เช่น การกระตุ้นเซลล์เม็ดเลือดขาว gene-3 (LAG-3) และ T cell immunoglobulin-3 (TIM-3) ตัวรับเหล่านี้มีความสำคัญอย่างยิ่งในฐานะศัตรูตัวฉกาจและตัวรับความเจ็บปวดในมะเร็ง และภูมิคุ้มกันทำลายตนเองอาจลดความน่าจะเป็นของเหตุการณ์ไม่พึงประสงค์ที่เกี่ยวข้องกับการบำบัด นอกจากนี้ การแสดงออกที่สูงของพวกมันยังเป็นลักษณะเฉพาะของ CD8+ ทีเซลล์ที่ผิดปกติซึ่งแสดงความสามารถในการสร้างใหม่ได้เองที่ต่ำและการทำงานของเอฟเฟกเตอร์ลดลง ความผิดปกติแสดงถึงกลไกความทนทานต่ออุปกรณ์ต่อพ่วงและขัดขวางการพัฒนาภูมิคุ้มกันต่อต้านเนื้องอก ดังนั้น นักวิจัยจึงพัฒนาวิธีการรักษาด้วย ICB เพื่อแทรกแซงฟีโนไทป์ที่ผิดปกติ อย่างไรก็ตามการมีส่วนร่วมของความผิดปกติสำหรับภูมิต้านทานผิดปกติอาจเป็นประโยชน์

ผลของฮอร์โมนสเตียรอยด์ต่อการควบคุมทีเซลล์
สเตอรอยด์ฮอร์โมน ได้แก่ คอร์ติโคสเตียรอยด์ (เช่น กลูโคคอร์ติคอยด์ (GCs) และเซ็กสเตอรอยด์ (เช่น แอนโดรเจน) มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการตอบสนองของภูมิคุ้มกันในภูมิต้านทานตนเองและมะเร็ง ทั้งหมดนี้เป็นอนุพันธ์ของสารตั้งต้นของสเตียรอยด์ชนิดเดียวกัน (pregnenolone) เช่นเดียวกับ GCs แอนโดรเจนยับยั้งภูมิคุ้มกันโดยหาเหตุผลว่าเหตุใดโรคภูมิต้านตนเองส่วนใหญ่จึงพบบ่อยในเพศหญิงมากกว่าเพศชายโดยมีระดับแอนโดรเจนที่หมุนเวียนสูงกว่า ในทำนองเดียวกัน เพศชายมีตัวควบคุมภูมิต้านทานตนเอง (AIRE) สูงกว่า ซึ่งป้องกันภูมิต้านทานตนเองโดยการส่งเสริมความอดทนตนเองในระหว่างการพัฒนาทีเซลล์ ตัวรับแอนโดรเจนที่ถูกผูกไว้ (AR) ยังปรับปรุงการถอดรหัส AIRE